O acervo bibliográfico da Coleção Ivani e Jorge Yunes é composto de uma Biblioteca e uma Hemeroteca. A primeira, divide-se em duas seções: a Biblioteca de Literatura Brasileira, composta por livros raros, e a Biblioteca de Arte. O conjunto de livros raros é constituído, em sua maioria, por autores brasileiros, todos em suas primeiras edições e, em alguns casos, autografados e em tiragens limitadas. Há publicações excepcionais, como os Sermões do Padre Vieira (século 17). Da Biblioteca de Arte fazem parte livros de referência, destinados ao uso dos pesquisadores da coleção, uma vez que abarca todos os núcleos existentes na CIJY.
A Hemeroteca abriga revistas e jornais publicados entre 1840 e 1980. É um conjunto importante e raro, que inclui títulos essenciais para a história da arte e da cultura do Brasil. São exemplos a Klaxon, GAM, A Revista, Noigandres, Invenção, Arco e Flecha, Revista Verde, Mirante das Artes e A Bruxa.
Em 2018 foram realizados empréstimos para exposições no Instituto Tomie Ohtake (AI-5 50 ANOS; Alucinações Parciais), no MAM-SP (Ismael Nery: feminino e masculino) e Pinacoteca do Estado de São Paulo (Trabalho de artista: imagem e autoimagem).